O iogurte tem muitos efeitos benéficos no organismo, regulando o apetite e promovendo a digestão, mas é importante prestar atenção ao momento do consumo de iogurte, que é geralmente recomendado duas horas após as refeições. Os probióticos têm um efeito significativo na regulação das funções intestinais e, para pacientes com perturbações gastrointestinais crónicas, o iogurte é mais eficaz e é normalmente consumido duas horas após as refeições. No entanto, se consumido duas horas após uma refeição, a maior parte do ácido gástrico do estômago terá sido consumido pelos alimentos do organismo, pelo que o iogurte pode ser suplementado com uma grande quantidade de probióticos e pode também regular a flora intestinal, o que é benéfico para a saúde. É importante notar que o iogurte deve ser consumido à temperatura ambiente, e não aquecido, pois isso reduzirá o sabor e a nutrição do iogurte, e a actividade das bactérias lácticas no iogurte pode perder-se em grandes quantidades, reduzindo a sua eficácia.