A hidronefrose não costuma recuperar por si só e pode requerer medicação ou cirurgia, dependendo da causa da hidronefrose. A presença de hidronefrose pode significar que existe um problema com o sistema urinário, tal como obstrução das vias urinárias, ou pedras urinárias, pedras nos rins, estenose ureteral ou retenção urinária, tudo isto pode causar hidronefrose. Por conseguinte, pode dirigir-se ao departamento de urologia de um hospital normal para um exame. Só após o exame por instrumentos profissionais pode ser formulado um plano de tratamento. Se a hidronefrose for causada por pedras nos rins, a fisioterapia, tal como a litotripsia extracorpórea, pode ser realizada, e a hidronefrose irá melhorar gradualmente assim que as pedras nos rins forem removidas do corpo. Se o hidrocele for causado por estenose do tracto urinário, pode ser tratado por cirurgia minimamente invasiva, tal como um procedimento de dilatação do tracto urinário, que pode remover o hidrocele. Os doentes devem normalmente beber mais água para aumentar a produção de urina. Recomenda-se uma dieta leve e tentar não comer nada que esteja a arder, o que também pode causar dificuldades na micção e assim levar à ocorrência de hidronefrose.