O lúpus eritematoso sistémico (LES) em si não afecta a fertilidade das mulheres com LES. As doentes com LES com doença activa que requerem tratamento com glucocorticóides e medicamentos imunossupressores podem sofrer de distúrbios menstruais ou de função ovariana deficiente. As doentes com LES podem estar em alto risco imediatamente após a gravidez, aumentando as complicações da gravidez, tais como eclâmpsia, ruptura prematura de membranas, crescimento fetal prejudicado, anemia, trombocitopenia, hemorragia pós-parto e atraso na cicatrização das incisões. Os auto-anticorpos podem atravessar a placenta e invadir o feto, causando síndrome de lúpus ou lúpus neonatal, danos na pele, bloqueio atrioventricular congénito, e malformações de órgãos. A contracepção deve ser utilizada em pacientes que não têm um filho. Foi por estas razões que durante muito tempo alguns médicos pensaram que os doentes com LES não podiam ter filhos. Contudo, estudos e observações recentes mostraram que quando o LES é controlado satisfatoriamente e os órgãos vitais são estáveis, é possível conceber e dar à luz uma criança de inteligência e aparência física sólidas, desde que o momento da gravidez seja o mais adequado. Pode dizer-se que o lúpus já não é uma contra-indicação ao parto. A terapia profiláctica de baixa dose hormonal durante a gravidez é agora recomendada para pacientes com LES para prevenir a recorrência da doença durante a gravidez de forma significativa. É também benéfico na redução dos danos imunitários à placenta, reduzindo assim também o risco para o feto. A concepção deve basear-se numa doença estável, geralmente defendida há mais de um ano, a fim de minimizar a progressão do LES e melhorar os resultados da gravidez. Os critérios para determinar a actividade da doença LES incluem a escala do Grupo de Avaliação de Lúpus Britânico (BILAG), o Índice de Actividade da Doença LES (SLEDAI) e outros. Fáceis de compreender e apreender pelo próprio doente são proteínas urinárias positivas, níveis de C3 complementares diminuídos e níveis aumentados de anticorpos anti-dsDNA, alterações que indicam a actividade da doença. A ecografia eugénica pode ser utilizada durante a gravidez para determinar a idade gestacional, para compreender o desenvolvimento embrionário e para descartar anomalias fetais. Os doentes com anticorpos antifosfolípidos positivos devem ser tratados até que os anticorpos antifosfolípidos sejam negativos e a aspirina oral deve ser tomada durante a gravidez para prevenir tromboses ou abortos espontâneos. A amamentação é permitida para mães que tomam pequenas doses de prednisona (menos de 3 comprimidos) após o parto, enquanto que a amamentação não é recomendada para mães que tomam grandes doses de prednisona ou em combinação com outros medicamentos. Os altos níveis de estrogénio e lactogénio no corpo da mãe durante a amamentação podem ainda exacerbar a condição e a monitorização deve ainda ser aumentada durante este período. O lúpus neonatal é adquirido como resultado de receber passivamente anticorpos no sangue da mãe e manifesta-se principalmente como febre, lesões cutâneas, hepatoesplenomegalia e bloqueio cardíaco congénito. Os sinais e sintomas, para além dos que envolvem o coração, são transitórios e desaparecem com o tempo, uma vez que os anticorpos maternos desaparecem.