A doença de Crohn tem uma tendência para a recorrência e a taxa de recorrência permanece elevada mesmo após a cirurgia. Por conseguinte, na maioria dos casos, a doença de Crohn é tratada principalmente com medicina interna. A cirurgia só é considerada nos seguintes casos: 1. pacientes refractários para os quais o tratamento médico agressivo (vários meses) falhou; 2. pacientes com complicações graves, incluindo obstrução intestinal devido a estrangulamento intestinal, perfuração intestinal, fístulas, perda crónica de sangue ou hemorragia de natureza péptica (quando o tratamento médico conservador falhou), megacólon tóxico, infecção intra-abdominal com formação de abscesso ou cancro; 3. desnutrição que falhou com o tratamento médico, especialmente quando a paragem do crescimento ocorre em pacientes adolescentes. Tem sido relatado que a maioria dos pacientes com Crohn’s também apresentam recorrência de sintomas endoscópicos ou clínicos após ressecção, com uma taxa de recorrência endoscópica de cerca de 28%-73% e uma taxa de recorrência sintomática de cerca de 50% 1 ano após a cirurgia. Por conseguinte, a prevenção da recorrência pós-operatória é extremamente importante. Estudos demonstraram que o 6-MP ou AZA é eficaz na prevenção da recorrência da doença de Crohn após a cirurgia. 2-4 semanas após a cirurgia, a AZA foi iniciada em combinação com metronidazol, e a taxa de recorrência endoscópica após 3 meses foi de 34,3% em comparação com 52,6% no grupo de controlo. 43,7% da taxa de recorrência foi encontrada após 1 ano em comparação com 69% no grupo de controlo. Contudo, a utilização clínica da AZA é limitada pelo facto de a maioria dos pacientes ser intolerante a ela. Com 1 ano, o grau de inflamação endoscópica da mucosa era significativamente mais baixo e a taxa de recorrência endoscópica e de inflamação histológica era significativamente melhor do que no grupo de controlo. O estudo mais recente mostrou que os pacientes que receberam infliximab imediatamente 2-4 semanas após a cirurgia tiveram uma taxa de recorrência significativamente mais baixa, uma taxa de remissão clínica significativamente mais elevada e uma taxa significativamente mais elevada de cicatrização completa da mucosa com 3 anos de seguimento (72% vs. 20%) em comparação com os pacientes que foram rechaçados após a cirurgia. Houve também menos efeitos secundários em relação à AZA, sem diferença significativa em relação ao grupo placebo. Para além da medicação para prevenir a recorrência, os pacientes devem evitar estritamente factores de risco como fumar e tomar drogas semelhantes aos AINEs.