Durante a consulta, é comum encontrar grávidas com hepatite B que perguntam se podem fazer amniocentese para diagnóstico pré-natal. Nem toda a gravidez precisa de amniocentese, a amniocentese é principalmente para pacientes que precisam de diagnóstico pré-natal, incluindo alto risco de síndrome de Down, por exemplo, mulheres grávidas com mais de 35 anos, a partir da idade deste único aspeto atingiu o alto risco de indicadores de síndrome de Down 1/300, por isso é recomendado que todas as mulheres grávidas de idade avançada façam amniocentese. É igualmente necessário que todas as mulheres grávidas sejam submetidas a um rastreio da síndrome de Down durante os controlos de maternidade. Se o indicador do teste for superior a 1/250, trata-se também de um risco elevado e recomenda-se o diagnóstico pré-natal. O diagnóstico pré-natal também é recomendado para as mulheres que já tiveram um filho com Síndrome de Down ou malformado e que estão grávidas novamente. Se o feto apresentar uma anomalia cardíaca grave, obstrução intestinal ou fluido do trato urinário em exames de imagem como a ecografia durante a gravidez, o diagnóstico pré-natal é necessário para excluir anomalias cromossómicas. Se estas anomalias não estiverem combinadas com aberrações cromossómicas, a criança nascerá com a possibilidade de ser operada e pode ser corrigida cirurgicamente. No entanto, se houver uma combinação de anomalias cromossómicas, como a síndrome de Down, mesmo que a cirurgia seja realizada, a inteligência da criança e outros problemas constituem um encargo económico para a sociedade e para a família. Noutros casos, como a talassemia, que é uma doença genética familiar, em que ambos os parceiros são portadores do mesmo tipo, é necessária uma amniocentese para determinar se a criança é uma talassémica grave. Há também a mãe que é Rh-negativa e suspeita-se que a criança possa ter hemólise incompatível com Rh, sendo necessária uma amniocentese. Se houver suspeita de infeção intra-uterina, como pequeno crescimento fetal, ou malformações atípicas, alterações do tipo edema no feto, etc., é necessário descobrir se o feto tem infecções virais específicas, e é necessário fazer um diagnóstico pré-natal de TORCH. Se a mulher grávida é apenas portadora do vírus da hepatite B: o resultado do teste é: apenas positivo para o antigénio de superfície da hepatite B, função hepática normal, cópia do HBV-DNA inferior a 3 vezes 10, a mulher grávida tem 35 anos ou mais, ou menos de 35 anos, mas o resultado do rastreio pré-natal é de alto risco, ou a ultrassonografia sugere que o desenvolvimento fetal pode ser anormal, ou houve nascimentos anteriores de crianças com malformações ou crianças com doenças hereditárias graves, ou um dos casais tem anomalia cromossómica. Ou se um dos cônjuges tiver uma anomalia cromossómica, o diagnóstico pré-natal por amniocentese é possível e muito necessário. No caso da hepatite B, é importante observar os resultados dos penta-testes quantitativos da hepatite B, especialmente o antigénio e-, bem como o HBV-DNA quantitativo e as provas de função hepática. Os prós e os contras da amniocentese são ponderados em relação ao risco de a paciente ter uma criança deformada ou com atraso mental. Na prática, a probabilidade de um feto ser infetado com hepatite B na sequência de uma amniocentese é muito reduzida. Isto porque, se uma mulher grávida tiver uma carga viral elevada de hepatite B, o feto pode já estar infetado com hepatite B antes da realização da amniocentese. Nos hospitais normais, os médicos que efectuam a amniocentese seguem procedimentos assépticos rigorosos. Antes da amniocentese, é necessário fazer o teste para 4 doenças infecciosas (hepatite B, hepatite C, sífilis e VIH).