Estudos demonstraram que as crianças subsequentes de mães hipotiróides não controladas têm inteligência inferior e que cerca de 80% dessas crianças têm um QI inferior a 85 (apenas 5% das crianças de mães não hipotiróides têm um QI inferior a 85), o que é proporcional ao grau de hipotiroidismo. Embora o hipotiroidismo em mulheres grávidas precoces tenha pouco efeito sobre o feto, se o hipotiroidismo não for bem controlado até à 12ª semana de gravidez, o desenvolvimento do cérebro fetal é significativamente afectado. O cérebro fetal continua a desenvolver-se ao longo da gravidez, com o volume do cérebro a aumentar rapidamente após a diferenciação dos órgãos entre a 3ª e a 8ª semana de gravidez, e até ao 5º mês de gravidez o cérebro fetal está completamente desenvolvido. Os níveis de tiroxina da mãe são críticos para o desenvolvimento do cérebro fetal durante este período. A dosagem de tiroxina oral em mulheres grávidas hipotiróidas precisa frequentemente de ser aumentada, e a dosagem exacta é regulada por referência às medições de TSH, que são tomadas de 2 em 2 meses ao longo da gravidez.