Normalmente só os pequenos defeitos do septo ventricular têm a possibilidade de auto-cura. Os pequenos defeitos do septo ventricular não têm sintomas demasiado óbvios, os pacientes não experimentam fraqueza, ataques de pânico e outros sintomas, por isso, mesmo que haja auto-cura, não haverá sensações e mudanças muito óbvias. É também necessário fazer uma ecografia do coração para determinar se o coração sarou, uma vez que alguns pacientes podem não ouvir um sopro cardíaco, mas ter uma condição mais grave, muito provavelmente devido a uma hipertensão pulmonar grave. Na síndrome de Eisenmenger, a pressão ventricular direita é igual à pressão ventricular esquerda, mas nenhum sopro pode ser ouvido, o que é um sinal de doença cardíaca congénita em fase terminal.