Tanto defeitos perimembranosos como subpulmonares do septo ventricular, se grandes em diâmetro, resultam inevitavelmente num grande desvio de sangue da esquerda para o ventrículo direito, levando à hipertensão pulmonar e à redução da função cardíaca, e mesmo à morte devido a pneumonia e insuficiência cardíaca. Para este grupo de crianças, a cirurgia precoce é essencial para evitar as complicações e os efeitos de risco de vida dos defeitos do septo ventricular e para melhorar a qualidade de vida da criança. Com a rápida melhoria das técnicas e equipamentos de cirurgia cardíaca, circulação extracorpórea, anestesia e monitorização pós-operatória, é agora possível reparar defeitos do septo ventricular neste grupo de crianças no prazo de um ano de idade. Contudo, é importante notar que a cirurgia precoce é também um pré-requisito, ou seja, a criança deve ser tratada quando a pneumonia está largamente curada e a insuficiência cardíaca está largamente resolvida para garantir um resultado bem sucedido. No caso de pequenos defeitos do septo ventricular subpulmonar, recomenda-se a reparação do defeito do septo ventricular antes da idade de 1 ano se não houver sintomas óbvios, uma vez que a válvula aórtica também pode ser afectada pelo defeito do septo ventricular à medida que a criança envelhece, aumentando grandemente o risco e a dificuldade da cirurgia. Para defeitos do septo perimembranoso ventricular de menor diâmetro, é necessária cirurgia ou intervenção se o defeito não “crescer” até à idade escolar. Em centros médicos onde o tratamento cirúrgico da doença pré-cardíaca infantil é mais comum (por exemplo, Hospital Pequim Anzhen, Centro Médico Infantil de Xangai), a reparação cirúrgica de defeitos do septo ventricular pode ser realizada com um ou dois meses de vida (ou mesmo alguns dias após o nascimento) se a condição o exigir.