O objectivo da vacinação é proteger o organismo humano de certas doenças infecciosas, inoculando-o com uma vacina, vacina ou toxoide. Através da resposta imunitária, o corpo torna-se imune a estas doenças infecciosas e assim a hipótese de as contrair pode ser evitada ou reduzida. A vacinação em si não causa um maior desenvolvimento de malformações cardíacas, mas algumas reacções de gravidade variável podem ocorrer após determinadas vacinas. Em geral, as reacções locais não têm qualquer efeito sobre a função cardíaca, enquanto algumas reacções sistémicas (por exemplo, febre) podem aumentar a carga sobre o coração. Por conseguinte, a vacinação geral não é recomendada para crianças com doenças cardíacas congénitas que normalmente têm uma função cardíaca deficiente, especialmente se tiverem insuficiência cardíaca frequente ou se estiverem em insuficiência cardíaca crónica. No entanto, as crianças que normalmente têm bom funcionamento cardíaco e boa tolerância à actividade podem ser vacinadas. Para as crianças que se preparam para a cirurgia, é melhor evitar a vacinação durante 1 mês antes da cirurgia para prevenir reacções adversas devido à depressão do sistema imunitário em resultado do choque cirúrgico. A vacinação pode ser retomada 3 meses após a cirurgia para crianças submetidas a circulação extracorpórea, e 1 mês após a cirurgia intervencionista, uma vez que a função cardíaca tenha voltado ao normal. As crianças que não tenham sido vacinadas como previsto antes da cirurgia devido a função cardíaca ou outros problemas devem seguir o procedimento de vacinação para completar a porção em falta. Para crianças que tenham sido submetidas a cirurgia paliativa, se a sua função cardíaca ainda for fraca após a cirurgia, ou se as malformações cardíacas ainda forem evidentes, a decisão de administrar a vacinação deve ser tomada caso a caso. Portanto, a questão da vacinação para crianças com doenças cardíacas congénitas deve ser analisada caso a caso, e não é correcto dizer que não há qualquer vacinação. As indicações específicas podem ser controladas pelo pessoal de vacinação.