Existem muitas causas de infertilidade masculina e a indigestão do sémen é uma das causas mais comuns de infertilidade masculina. Os doentes têm geralmente uma função sexual e uma ejaculação normais e procuram frequentemente assistência médica porque são inférteis há muito tempo após o casamento. Devido à alta viscosidade do sémen, por vezes há ejaculação com esforço e ejaculação dolorosa e, em alguns casos, há também gotejamento branco ou sémen hematológico. Se o sémen não se liquefaz em 60 minutos à temperatura ambiente a 25°C, ou se ainda contém coágulos que não se liquefazem, pode chamar-se indigestão do sémen. O sémen normal liquefaz-se no momento da ejaculação e forma imediatamente uma geleia ou coágulo, que volta a liquefazer-se após 5 a 20 minutos. As secreções da próstata e das vesículas seminais estão envolvidas no processo de coagulação e liquefação do sémen. Os factores de coagulação produzidos pelas vesículas seminais provocam a coagulação do sémen, enquanto os factores de liquefação produzidos pela próstata, como as enzimas proteolíticas e a lisozima, provocam a liquefação do sémen. Quando ocorre uma inflamação das vesículas seminais ou da próstata, a secreção destes factores pode ser prejudicada, resultando num aumento dos factores de coagulação ou numa diminuição dos factores de liquefação, resultando na não liquefação do sémen. Este atraso anormal no processo de liquefação faz com que os espermatozóides coagulem ou travem, e o movimento dentro do trato reprodutor feminino é significativamente dificultado, impedindo o movimento ascendente para o canal cervical, cavidade uterina e trompas de Falópio, onde não podem encontrar o óvulo.