O sémen contém uma variedade de substâncias, tais como altas concentrações de substâncias orgânicas, iões inorgânicos e várias enzimas. Muitas das enzimas associadas à coagulação ou liquefação do sémen provêm do líquido prostático, como a aminopeptidase, as enzimas fibrinolíticas e a arginina éster hidrolase. Além disso, o ácido cítrico é secretado inteiramente pela glândula prostática, e o seu papel é manter a pressão osmótica do sémen e a atividade da hialuronidase do esperma. As causas comuns de não-liquidez do sémen são a insuficiência de enzimas fibrinolíticas segregadas pela próstata devido a vesiculite seminal e prostatite; a deficiência de oligoelementos (magnésio, zinco, etc.); a deficiência congénita da próstata, etc. As secreções da próstata e das vesículas seminais estão envolvidas na coagulação e na liquefação do sémen. Os factores de coagulação produzidos pelas vesículas seminais provocam a coagulação do sémen, enquanto os factores de liquefação produzidos pela próstata, como as enzimas proteolíticas e as enzimas fibrinolíticas, provocam a liquefação do sémen. Quando ocorre uma inflamação nas vesículas seminais ou na próstata, a secreção destes factores pode ser prejudicada, resultando num aumento dos factores de coagulação ou numa diminuição dos factores de liquefação, resultando na não liquefação do sémen. A glândula prostática e as vesículas seminais estão ambas abertas ao monte seminal, e cerca de 60% dos pacientes com prostatite têm vesículas seminais, resultando em hematospermia e ejaculação dolorosa, a secreção de fluido prostático diminui quando a próstata está inflamada, resultando em uma diminuição na quantidade de sêmen, o que não é propício para a sobrevivência e atividade dos espermatozóides. A atividade das enzimas no líquido prostático diminui e o fator de coagulação aumenta, pelo que o sémen demora mais tempo a liquefazer-se após a descarga. O pH do sémen diminui, de alcalino para ácido. Quando o pH desce para 6-6,5, a viabilidade dos espermatozóides diminui, resultando em espermatozóides mortos ou fracos. As substâncias mais nocivas, tais como bactérias e toxinas bacterianas e secreções inflamatórias no fluido da próstata, podem esgotar os nutrientes e o oxigénio no sémen, afectando assim a sobrevivência e a motilidade dos espermatozóides e conduzindo à infertilidade.