Os defeitos do septo ventricular são o tipo mais comum de doença cardíaca congénita, representando cerca de 25% de todos os casos. Pequenos defeitos do septo ventricular podem tornar-se gradualmente menores ou sarar espontaneamente dentro do primeiro ano de vida, e cerca de 25-40% dos defeitos do septo ventricular podem fechar e sarar por si mesmos até à idade de 3-4 anos. Pequenos defeitos do septo ventricular, defeitos perimembranosos e miocárdicos tendem a sarar espontaneamente, e mesmo cerca de 7% dos grandes defeitos do septo ventricular com insuficiência cardíaca têm uma hipótese de sarar espontaneamente. Além disso, o tratamento médico de grandes defeitos do septo ventricular em qualquer idade não é eficaz e o tratamento cirúrgico é indicado. A cirurgia é ainda necessária em bebés com hipertensão pulmonar, relações de circulação pulmonar para o corpo superiores a 2:1, e defeitos do septo supraespinhal ventricular. Os pequenos defeitos do septo ventricular devem ser reparados nos anos pré-escolares, devido ao risco de pericardite infecciosa.