A cistoscopia de ultra-sons de modo B comummente utilizada, a SPECT (single proton elected compute rized tomography) e, mais recentemente, a CT em espiral seguida de reconstrução tridimensional e endoscopia simulada (lendoscopia intra-luminosa virtural (VIE) e colangio-pancreatografia de ressonância magnética (MRCP), podem todas fornecer um diagnóstico mais definitivo dos cistos congénitos de ductos biliares comuns. O diagnóstico dos cistos congénitos de ductos biliares comuns pode ser feito com a ajuda da colonangiopancreatografia de ressonância magnética (MRCP). O diagnóstico não é difícil quando combinado com a apresentação clínica de dor abdominal, massas e icterícia.