O exercício físico é tão importante como a medicação no tratamento da espondilite anquilosante. Alguns dos exercícios mais adequados são: natação, yoga, jogging e tai chi. Ao nadar, o corpo está numa posição plana na água e a flutuabilidade contraria o efeito da gravidade, pelo que todas as articulações e músculos são efectivamente exercitados. É melhor evitar desportos de alta intensidade como a luta-livre, o ténis, o basquetebol e o ténis de mesa. Ao praticar desporto, os treinadores com palmilhas almofadadas devem ser usados para reduzir o trauma nas articulações. Deve também ser dada especial ênfase aos pacientes com lesões da articulação da anca para insistir em exercícios funcionais para a articulação da anca, tais como rapto e agachamento, a fim de manter um bom estado funcional da articulação e reduzir a possibilidade de incapacidade articular. O exercício físico é propício à manutenção da mobilidade do tórax, mantendo a flexibilidade da coluna vertebral, mantendo a função motora dos membros, prevenindo ou reduzindo a atrofia muscular devido ao desuso dos membros, mantendo a densidade e força óssea, e prevenindo a osteoporose, etc. Embora a medicação seja enfatizada, o exercício físico não deve ser negligenciado. Não se deve estar acamado e não disposto a mover-se por causa da dor, pois isto só acelerará o progresso da doença.