A causa e patogénese da espondilite anquilosante não é clara, e a maioria dos estudiosos acredita que a sua ocorrência está relacionada com a genética, infecção, disfunção imunológica e distúrbios endócrinos. O HLA-B27 foi o primeiro gene proposto para ser associado ao desenvolvimento do EA, e a investigação confirmou que o HLA-B27 está directamente envolvido no desenvolvimento do EA e é o principal componente associado do EA. Com o avanço da investigação genética e das técnicas científicas, foi proposto associar ao desenvolvimento do AS um grande número de genes para além do HLA-B27. 2. factores imunitários: a deficiência auto-imune está associada ao AS, e os doentes com AS têm um grande número de células T inflamatórias e monócitos-macrófagos infiltrando-se nos ossos, articulações e tecidos sinoviais, e têm uma resposta imunitária. 3. factores infecciosos: Os principais que têm sido sugeridos como possivelmente relacionados com o desenvolvimento de AS são Klebsiella pneumoniae, Salmonella e outras bactérias G parasitárias intestinais e Chlamydia que causam infecções das vias respiratórias superiores e infecções intestinais. Foi relatado que o trauma, a doença paratiróide, os defeitos endócrinos e metabólicos foram associados ao desenvolvimento do AS. Factores ambientais tais como vento, humidade e frio são também factores causadores da doença. Investigações de populações especiais descobriram que posturas de trabalho fixas e formação local estereotipada podem desencadear o AS.