As cavidades espinais são mais frequentemente causadas pela malformação Chiari (hérnia subungueal das amígdalas cerebelares). A patogénese da malformação de Chiari pode ocorrer no terceiro trimestre do feto, durante o período embrionário, quando o desenvolvimento do osso occipital é atrasado e atrasado devido à hipoplasia da porção occipital dos somitos mesodérmicos, enquanto o cerebelo e o tronco cerebral se desenvolvem normalmente, permitindo que as estruturas cerebrais posteriores que normalmente se desenvolvem hérnia no canal espinhal após o nascimento devido à compressão excessiva da fossa craniana posterior. A patogénese das malformações associadas à cavitação medular: teoria hidrodinâmica; teoria da separação de pressão intracraniana e intra-craniana; teoria da infiltração parenquimatosa do líquido cefalorraquidiano; associada a vias de saída de líquido cefalorraquidiano anormais na área do forame occipital maior.