A extremidade inferior do esófago é coberta com epitélio colunar anormal e chama-se esófago de Barrett. É geralmente considerado adquirido e está intimamente associado à esofagite de refluxo, com a possibilidade de adenocarcinoma, e foi descrito pela primeira vez por Norman Barrett em 1950. Clinicamente, verificou-se a ocorrência de danos na mucosa do esófago inferior com migração epitelial colunar com fluido gástrico ácido do refluxo gastro-esofágico e refluxo do fluido intestinal alcalino após gastrectomia total. O desenvolvimento do esófago de Barrett é também facilitado pela contratilidade reduzida do esfíncter esofágico inferior e pela redução da depuração do esófago após o desenvolvimento da esofagite de refluxo. O refluxo, que inclui um ou mais de ácido gástrico, pepsina, enzimas pancreáticas e ácidos biliares, contribui para a metaplasia epitelial escamosa em doentes com DRGE. A ruptura do epitélio escamoso é seguida pela reepitelização do epitélio colunar gástrico no cartão em direcção à extremidade cefálica da zona danificada do esófago. Noutros casos raros, o esófago de Barrett pode ocorrer como resultado de queimaduras corrosivas no esófago ou danos na mucosa do esófago durante a quimioterapia anti-cancerígena a longo prazo. A relação causal entre a disfunção motora esofágica e o esófago epitelial colunar não é totalmente compreendida. A possibilidade de carcinoma do epitélio colunar do esófago foi identificada durante o acompanhamento a longo prazo.