Existem cinco subtipos patológicos de medulloblastoma: clássico, desmoplástico, MBEN, célula grande e anaplásico. O prognóstico é melhor para os tipos pró-fibroblásticos e de formação de nódulos extensivos, que são mais comuns em doentes com menos de 5 anos e adultos e têm um prognóstico relativamente bom; o pior prognóstico é para os tipos de meduloblastoma de grandes células e mesenquimais. Como ambos os tipos têm um mau prognóstico, normalmente referimo-nos a eles como tipos LC/A. A incidência de medulloblastoma LC/A é baixa, e dos cinco subtipos de medulloblastoma, os tipos LC/A representam a menor proporção e têm o pior prognóstico. O prognóstico do medulloblastoma clássico, por outro lado, é mais variável e impossível de julgar. O significado clínico destes cinco subtipos patológicos é relativo e não pode ser absolutizado, e a sua precisão é menor do que a da tipagem molecular.