O custo da colonoscopia é relativamente barato. Uma colonoscopia normal custa geralmente$350 e uma colonoscopia sem dor com anestesia custa$800-1000. Antes da colonoscopia ser feita, o paciente é submetido a uma análise ao sangue para excluir doenças infecciosas como a hepatite A, hepatite B, hepatite C, SIDA e sífilis, e uma limpeza intestinal, que requer laxantes orais incluindo manitol e electrólitos de polietilenoglicol, etc. O custo dos laxantes 100-200 RMB. Após a colonoscopia, alguns pacientes mostrarão inchaço porque têm de ser bombeados durante a colonoscopia. Após a colonoscopia, o desabafo e a fricção do estômago irá aliviá-los em 2-3 horas.