Beber vinagre é prejudicial ao estômago, o vinagre é um químico ácido que pode baixar o valor do pH do estômago, o vinagre pode estimular a mucosa gástrica quando bebido no estômago, o que pode causar danos na mucosa gástrica em casos graves, formando gastrite erosiva ou mesmo úlcera gástrica, causando assim uma série de sintomas digestivos, tais como dores de estômago, inchaço, indigestão, etc. Em casos graves, pode ocorrer sangue nas fezes, pelo que as pessoas normais devem tentar beber menos vinagre. Além disso, pacientes com doenças gástricas, tais como gastrite erosiva, úlcera gástrica, úlcera duodenal não devem beber vinagre, porque o vinagre pode acelerar a destruição da mucosa gástrica, resultando numa variedade de sintomas agravados, resultando no agravamento da doença primária, pelo que devem tentar beber menos vinagre.