A deglutição anormal é frequentemente um sintoma de muitas doenças musculares, e quando ocorre leva frequentemente a dificuldades alimentares, levando a desnutrição e agravando ainda mais a doença muscular, e mais problematicamente a aspiração, causando pneumonia, e fraqueza muscular respiratória, levando a pneumonia prolongada e tornando-se uma causa principal de morte por este tipo de doença. É por isso importante compreender a função de deglutição do doente e desenvolver medidas preventivas para prevenir a pneumonia por aspiração. As principais disfunções musculares que se apresentam com disfunção de deglutição são a distrofia miotónica anquilosante, a distrofia miotónica oculofaríngea e a distrofia miotónica distal oculofaríngea, que também são frequentemente observadas na miosite corporal de inclusão e na doença de neurónios motores. A doença cerebrovascular e a doença de Parkinson estão também frequentemente associadas a uma deglutição anormal. O tipo de disfagia é determinado e pode ser resolvido através da alteração do ângulo de alimentação, postura e tipo de objecto, ou em alguns casos, por cirurgia.