A ocorrência de pedras de pigmento biliares está intimamente relacionada com a estrutura alimentar, práticas de higiene e infecções do tracto biliar. A principal causa destas é a infecção do tracto biliar. A infecção pode ser parasitária, bacteriana ou ambas (mista). As infecções do tracto biliar podem levar a lesões na mucosa dos canais biliares, estase biliar, etc., que com o tempo podem levar a pedras de pigmento biliar. As pedras de pigmento biliares são geralmente soltas e a bílis pode ser filtrada inicialmente através das pedras. Uma vez desenvolvida a inflamação do ducto biliar comum, os sintomas de obstrução do ducto biliar podem agravar-se e a dor abdominal pode tornar-se mais grave com crises de febre, que podem ser moderadas a elevadas e podem causar um aumento progressivo da icterícia.