A cirurgia não é recomendada para os quistos do ovário. Normalmente, considera-se que se trata de um quisto do ovário funcional ou de um quisto do ovário relativamente pequeno, mas se o quisto aumentar de tamanho ou se suspeitar que é de natureza problemática, o médico recomendará a cirurgia. Os quistos ováricos funcionais, também designados por quistos fisiológicos, são normalmente assintomáticos e, na sua maioria, não afectam a sua saúde, crescem e desaparecem por si próprios com o ciclo menstrual, pelo que a cirurgia não é recomendada e os exames regulares são normalmente suficientes. No caso de alguns quistos mais pequenos com sintomas ligeiros, podem ser tratados primeiro de forma conservadora, como pílulas contraceptivas orais de ação curta, ou utilizando antibióticos sensíveis para tratamento quando existe uma infeção combinada, que pode normalmente ser controlada. A cirurgia é um tipo de tratamento traumático, se pode desaparecer por si só ou ser tratada de forma conservadora, a cirurgia geralmente não é recomendada, mas em alguns casos, a cirurgia ainda é necessária, como cistos ≥5cm de diâmetro, cistos que não podem desaparecer por conta própria após 3-6 meses, crescimento mais rápido, ou rutura e torção, etc., neste caso, a cirurgia pode ser realizada. Os cistos ovarianos devem ser tratados em estrita conformidade com as instruções do médico e geralmente se comunicam com o médico com mais frequência.