Os danos causados pela doença hepática autoimune à função hepática demoram geralmente mais de meio ano a recuperar, mas o período exato de tempo está relacionado com a gravidade da doença e o efeito do tratamento.
A doença hepática autoimune é causada por distúrbios de auto-anticorpos, ou seja, factores auto-imunes que provocam danos no fígado. As mais comuns incluem a hepatite autoimune, a colangite esclerosante autoimune e a cirrose biliar primária. Destes, a hepatite autoimune provoca uma elevação das aminotransferases, das transpeptidases e das fosfatases.
Se o fígado não for gravemente afetado, se não houver danos evidentes na morfologia e na estrutura do fígado e se o valor das transaminases não estiver demasiado elevado, abaixo de 100 U/L, em geral, através de medicação ativa de proteção do fígado, pode ser gradualmente reposto ao normal em cerca de duas semanas.
No entanto, se os danos provocados pela doença hepática autoimune não tiverem sido eficazmente controlados, de modo que a função hepática continue a diminuir e o valor das transaminases tenha sido elevado acima de 200 U/L, o tempo de recuperação da normalização é relativamente longo e pode demorar mais de meio ano, podendo mesmo ser acompanhado por um período de vida prolongado, até à morte.