Recomenda-se que os recém-nascidos com função tiroideia anormal sejam submetidos a um exame mais aprofundado após o rastreio inicial positivo e, uma vez confirmado o diagnóstico de hipotiroidismo congénito, é necessária medicação sob a orientação do médico.
Recém-nascidos com função tiroideia anormal, o rastreio inicial positivo recomendado para melhorar o conjunto completo de testes da função tiroideia, se os resultados do teste mostrarem que a hormona tiroideia no sangue é baixa, acompanhada por níveis elevados de hormona estimulante da tiroide pode ser diagnosticada como hipotiroidismo congénito.
Uma vez confirmado o diagnóstico de hipotiroidismo congénito, o doente deve ser tratado com comprimidos de levotiroxina sódica, conforme prescrito pelo médico, para manter o nível de hormona tiroideia no sangue dentro de um intervalo razoável, e a função tiroideia deve ser verificada regularmente.
No caso de hipotiroidismo neonatal, recomenda-se que o recém-nascido seja visto por um médico para tratamento de um teste de rastreio positivo.