A principal razão pela qual as crianças continuam a ter dores de cabeça mesmo depois de terem recuperado da encefalite é que os danos nas células nervosas do cérebro não foram totalmente reparados, porque embora a criança tenha recuperado da encefalite e não apresente sintomas agudos como febre, convulsões ou vómitos, demora muito tempo a reparar as células nervosas, o que pode causar dores de cabeça prolongadas nas crianças. Neste caso, as crianças podem ser tratadas com medicamentos que alimentam os nervos, tais como o hidrolisado de cerebroproteína, que pode alimentar os nervos cerebrais e aliviar a dor de cabeça prolongada causada pela encefalite e tem um bom perfil de segurança.