A dor da encefalite distribui-se à volta do tecido doente e é difícil de identificar. Quando a lesão afecta as meninges, é frequentemente distribuída de forma difusa, geralmente com uma dor predominantemente distendente, e pode haver uma dor hiperactiva quando a cabeça é baixada na região occipital posterior, sugerindo sinais positivos de irritação meníngea. Além disso, os pacientes com diferentes tipos de encefalite, tais como encefalite epidémica B, encefalite séptica e encefalite tuberculosa, têm diferentes sintomas de dor de cabeça: 1. encefalite epidémica B: desenvolve-se principalmente no Verão e no Outono e pode ser disseminada por picadas de mosquitos. Os doentes têm uma dor de cabeça persistente, que pode ser acompanhada por uma dor de cabeça baça; 2. encefalite séptica: uma doença infecciosa causada por bactérias sépticas, a dor de cabeça é na sua maioria aguda e dolorosa em todo o cérebro, acompanhada por uma sensação de ardor na cabeça ou dor vaga persistente; 3. mas de maior duração. Os doentes com encefalite sofrem de dores de cabeça porque a inflamação irrita o tecido meníngeo, que está densamente cheio de fibras nociceptivas. O edema e hemorragia do tecido cerebral levam ao aumento da pressão intracraniana, causando compressão do cérebro e dos tecidos adjacentes associados. Quando o tecido cerebral se torna edematoso e exsuda, irrita e puxa as meninges, nervos cranianos e vasos sanguíneos na base do crânio que têm estruturas sensíveis à dor, causando assim uma dor de cabeça puxada. O tratamento actual destina-se geralmente a reduzir a pressão craniana, controlar a inflamação e a terapia antiviral para aliviar a condição.