A cor escura da menstruação deve-se principalmente ao baixo fluxo menstrual, combinado com a cor castanha escura ou preta do sangue, devido ao ambiente ácido da vagina. Há muitas causas de baixo fluxo menstrual, incluindo as causas endócrinas e as causas uterinas. As causas endócrinas são grandes conceitos como disfunção hipotalâmica, disfunção ovariana e disfunção da tiróide, todas elas podem causar perturbações endócrinas e consequentemente baixo fluxo menstrual. As causas do útero incluem factores congénitos de desenvolvimento, tais como um pequeno útero. Factores adquiridos, tais como danos no revestimento do útero após aborto causando baixo fluxo menstrual, má reparação de cicatrizes após cesariana também podem causar baixo fluxo menstrual, períodos prolongados, baixo fluxo menstrual e cor escura. É aconselhável ir ao hospital para um exame minucioso para ver quais são as causas do baixo fluxo menstrual.