Os testes HPV de alto risco são utilizados principalmente para o rastreio do cancro do colo do útero e os três métodos comummente utilizados são o rastreio combinado de HPV, o rastreio citológico e o rastreio de HPV por si só. O rastreio combinado começa aos 30 anos de idade e termina aos 65 anos de idade. O rastreio combinado pode ser feito utilizando testes HPV tipados e não tipados, sendo os testes tipados geralmente utilizados. Se todos os co-ensaios forem negativos, o co-ensaios é realizado de cinco em cinco anos; HPV positivo com citologia escamosa atípica, a colposcopia pode ser realizada directamente; HPV positivo com citologia negativa, o co-ensaios é repetido aos 12 meses ou os testes de tipagem HPV são realizados para os tipos de HPV 16 e 18. Citologia negativa ao HPV para células escamosas atípicas, rastreio combinado de 3 em 3 anos. Mulheres com lesões intra-epiteliais escamosas de baixo grau do colo do útero, lesões intra-epiteliais escamosas de alto grau do colo do útero e carcinoma epitélico escamoso de células em citologia são rastreadas directamente com colposcopia, independentemente do resultado do HPV.