Os principais tratamentos para a pielonefrite são a terapia geral e a medicação.
Em geral, a pielonefrite aguda é tratada principalmente com antibióticos; para a pielonefrite crónica, a chave do tratamento é encontrar a causa e tratá-la para essa causa.
O tratamento geral da pielonefrite inclui repouso, evitar esforço, beber muitos líquidos e urinar regularmente.
A medicação para a pielonefrite é principalmente o tratamento antibiótico. Os antibióticos normalmente utilizados incluem fluoroquinolonas, penicilinas semi-sintéticas e cefalosporinas. Medicamentos específicos devem ser administrados sob a orientação de um médico.