Um cisto tiroglossal é geralmente uma massa redonda de 1 – 2 cm de diâmetro. A maioria das massas está localizada na linha média do pescoço, algumas podem estar ligeiramente de um lado, com margens claras, frequentemente com uma sensação parenquimatosa à massa devido à tensão das secreções que enchem a cápsula. A massa pode mover-se para cima e para baixo em resposta aos movimentos de extensão da língua, que é característica da mesma. Em casos sem infecção, o cisto não adere à pele, não é doloroso e não interfere com os movimentos de deglutição. Quando o quisto se infecta, caracteriza-se por dor, pressão e vermelhidão da pele, e quando rebenta, uma secreção purulenta flui para fora. A fístula pode sarar temporariamente após um certo período de tempo, mas pouco depois decompõe-se por sua própria iniciativa, e isto pode acontecer repetidamente ao longo dos anos. Uma vez estabelecido o diagnóstico de um cisto tiroglossal, deve procurar-se a remoção cirúrgica antes de se desenvolver a infecção. Se o quisto não estiver infectado, a cirurgia pode ser realizada após os 2 anos de idade, uma vez que a ponta do quisto está ligada ao osso hióide e a fístula passa através da parte central do osso hióide.