A abóbora é um vegetal comummente consumido, rico em vitaminas, minerais, fibras alimentares e fitoquímicos. O consumo diário normal não é prejudicial. Contudo, o consumo a longo prazo em grandes quantidades pode levar à xantose carotenóide, ou seja, ao amarelecimento da pele. Em casos graves, também pode ser um fardo para o fígado e até levar a doenças hepáticas. A abóbora contém mais amido do que outros vegetais e não deve ser consumida por pessoas com baixo nível de açúcar no sangue ou diabéticos, ou como substituto de alimentos básicos, para evitar um aumento do açúcar no sangue. As pessoas com fraca motilidade gastrointestinal também não devem consumir demasiado, pois pode causar inchaço, soluços, dores abdominais e outros sintomas desagradáveis, e pode levar a diarreia em casos graves. Alguns doentes são alérgicos à abóbora e podem sofrer reacções alérgicas tais como comichão na pele, espirros e corrimento nasal após o consumo. A abóbora é de natureza quente e não deve ser consumida por longos períodos de tempo ou em excesso por doentes que sofrem de vermes, icterícia, mau hálito, úlceras estomacais, gastrite aguda e crónica, uma vez que isto pode agravar a condição e não é conducente à recuperação.