Uma criança com febre baixa e dores de cabeça pode não ter necessariamente encefalite. Uma constipação comum terá sintomas locais tais como tosse seca, dor de garganta e corrimento nasal, bem como sintomas sistémicos tais como febre, dor de cabeça, irritabilidade e fadiga, que são geralmente ligeiros e podem ser melhorados com tratamento apropriado. A encefalite pode ser aguda no início e pode ser precedida por uma história de infecções respiratórias superiores ou gastrointestinais durante vários dias, e pode também apresentar sintomas de febre, dor de cabeça, vómitos, diarreia, corrimento nasal e nariz entupido, algo semelhante aos da gripe. No entanto, com tratamento geral, os sintomas não melhorarão e podem mesmo agravar-se com os seguintes sintomas: 1. sintomas de intoxicação por infecção e disfunção cerebral: incluindo febre, convulsões, agitação, agravamento progressivo da consciência. Outros sintomas incluem comportamento mental e emocional anormal, e paralisia dos membros, visão turva e audição deficiente. 2. Sintomas de aumento da pressão intracraniana: em crianças mais velhas, os principais sintomas são dores de cabeça persistentes e vómitos frequentes, enquanto que em bebés e crianças pequenas, os sintomas são fontanela completa, tónus aumentado, aumento da circunferência da cabeça, irritabilidade, gritos, vómitos, palidez, suores frios, e membros tónicos ou hipertónicos. Se alguma destas condições ocorrer, a encefalite deve ser considerada e são necessárias mais consultas para evitar atrasos.