Após a remoção dos quistos dos ovários, a maioria das pessoas não tem sequelas, enquanto um pequeno número de pessoas pode sofrer de hemorragias e infecções pós-operatórias e, em casos graves, a função ovárica pode ser afetada, levando à falência prematura dos ovários. A cistectomia do ovário é uma cirurgia ginecológica comum e uma cirurgia muito madura. Após a cirurgia, a função ovárica pode ser restabelecida na grande maioria das pessoas sem sequelas. Se os quistos forem de grandes dimensões e ricos em vasos sanguíneos, a hemostase incompleta do traumatismo durante a operação pode levar a hemorragia pós-operatória. Se a infeção não for controlada antes da operação, a infeção pós-operatória e a infeção da incisão ocorrerão facilmente. Se o córtex ovariano for danificado durante a cirurgia, pode afetar a função ovariana e levar à insuficiência ovariana prematura, que tem uma baixa incidência.