É possível engravidar com uma injecção hipodérmica porque é administrada na fase média-lútea e já ovulou, pelo que existe a possibilidade de gravidez. Outra razão é que o GnRH-a, um agonista da hormona libertadora de gonadotropina, tem um efeito de flare-up na hipófise e a injecção inicial pode estimular a hipófise a produzir hormona FSH, promovendo assim o desenvolvimento folicular. Uma vez desenvolvidos os folículos, é possível a gravidez, pelo que a contracepção é necessária durante o período de queda. Se a gravidez ocorrer durante o período de down-regulation, há um risco de supressão da função pituitária levando à insuficiência luteal, aumentando a probabilidade de aborto espontâneo. Além disso, se a gravidez ocorrer durante o período de down-regulation, é necessário um tratamento de controlo da fertilidade.