A diarreia é causada pela ingestão de enzimas porque estas podem ajudar a eliminar as fezes. A principal razão para a diarreia é o facto de as enzimas conterem uma grande quantidade de celulose, flora probiótica e muitos tipos de enzimas digestivas, que se misturam com as fezes para absorver água e inchar para tornar os movimentos intestinais suaves. A flora probiótica pode promover a actividade intestinal e melhorar a absorção, de modo a que vários alimentos sejam decompostos em pequenas moléculas e excretados para fora do corpo, daí o fenómeno da diarreia. Tomar enzimas para a diarreia é bom para a desintoxicação e laxação, e não há desconforto depois de tomar enzimas para a diarreia, mas sim uma sensação de alívio. As enzimas são benéficas para o corpo humano e podem melhorar a imunidade e o metabolismo do corpo. No entanto, é importante não comer alimentos picantes e ácidos enquanto estiver a tomar enzimas para evitar causar desconforto no estômago e nos intestinos. Também é importante não tomar demasiadas enzimas, pois podem provocar movimentos intestinais excessivos, o que pode levar à desidratação e a outros desconfortos e afectar a saúde.