Normalmente, a recuperação de uma craniotomia demora cerca de 2 a 3 semanas, sendo mais demorada no caso de doenças graves. Isto é determinado caso a caso e tem muito a ver com a qualidade do próprio doente. O grau de desenvolvimento das doenças dos diferentes doentes após a craniotomia varia, pelo que o tempo de recuperação também varia de pessoa para pessoa. Os doentes com doenças primárias graves podem não conseguir manter a sua vida após a cirurgia e, se os sinais vitais do doente forem instáveis após a cirurgia, têm de ir para a unidade de cuidados intensivos para serem observados de perto, e o tempo de recuperação pode ser de três meses ou até mais, e alguns doentes podem mesmo desenvolver um estado vegetativo. Os doentes com doenças relativamente ligeiras necessitam normalmente de cerca de 2 a 3 semanas para recuperarem gradualmente. Após a craniotomia, os doentes devem prestar atenção a boas medidas de condicionamento pós-operatório e os familiares devem cuidar bem dos doentes para evitar acidentes. Se houver alguma doença relacionada, recomenda-se que se dirija atempadamente ao hospital.