O refluxo biliar é tratado com medicamentos, incluindo os seguintes: 1) medicamentos de motilidade gastrointestinal, como a morfolina; 2) medicamentos de protecção da mucosa gástrica oral, como o Daxil; 3) terapia de supressão de ácidos, incluindo bloqueadores dos receptores H2 e inibidores da bomba de protões, incluindo ranitidina e loxacilina; 4) verificar a presença de H. pylori e, em caso afirmativo, tratar o H. pylori. Em geral, o refluxo biliar deve ser tratado com medicação além da dieta. Se a medicação não for eficaz e o refluxo biliar for muito grave, a cirurgia não pode ser excluída.