Existem dois tipos de extracção de medula óssea. Se o objectivo for diagnosticar uma doença hematológica ou determinar a eficácia do tratamento de uma doença hematológica, a medula óssea pode ser extraída da espinha ilíaca superior anterior, espinha ilíaca superior posterior ou esterno, e a medula óssea extraída pode ser examinada para diagnosticar a doença ou determinar a eficácia do tratamento. No caso de transplante de medula óssea, a quantidade de células estaminais de sangue necessária é muitas vezes demasiado grande para ser feita por simples aspiração de medula óssea. Ao paciente é normalmente administrada uma injecção subcutânea de granulócitos para mobilizar as células estaminais do sangue da medula óssea para o sangue periférico. Quando o número de células estaminais do sangue no sangue periférico tiver atingido um determinado nível, pode ser utilizado um separador de células sanguíneas para separar as células estaminais do sangue da circulação do corpo através de uma veia e armazená-las para utilização num transplante de medula óssea. Assim, onde a medula óssea é extraída, dependerá das necessidades específicas.