Os comprimidos de idebenona são utilizados para tratar doenças cerebrovasculares crónicas e perturbações da função cerebral causadas por lesões cerebrais traumáticas, etc. Podem melhorar o desconforto subjectivo dos pacientes, perturbações do comportamento mental, tais como fala, ansiedade, depressão, perda de memória e diminuição da inteligência. A incidência de reacções adversas é de cerca de 3%, principalmente reacções alérgicas, erupção cutânea, náuseas, perda de apetite, diarreia e outras reacções gastrointestinais, mas também possíveis sintomas mentais tais como excitação, insónia e tonturas. Ocasionalmente, observa-se supressão da medula óssea, redução da contagem de glóbulos brancos e diminuição da função hepática.