No caso de intoxicação alimentar, o aleitamento materno não é geralmente permitido. Os tipos mais comuns de intoxicação alimentar são a intoxicação alimentar bacteriana ou a intoxicação alimentar por toxinas químicas, sendo a intoxicação alimentar bacteriana a mais comum. Quer se trate de intoxicação alimentar bacteriana ou intoxicação alimentar causada por toxinas químicas, estas bactérias e toxinas entrarão na corrente sanguínea do organismo com os alimentos consumidos e absorvidos através do tracto gastrointestinal. As toxinas e bactérias absorvidas são também excretadas através do leite materno. Se uma criança comer esse leite, também será contaminada com bactérias ou toxinas químicas e a criança pode também sofrer de intoxicação alimentar. Portanto, se ocorrer uma intoxicação alimentar, a amamentação precisa de ser interrompida, o tratamento sintomático activamente administrado, e os antídotos específicos aplicados até que os sintomas maternos da mãe sejam completamente aliviados antes de a amamentação poder recomeçar.