Muitas doenças podem ser complicadas pela febre, tornando o diagnóstico diferencial de febre mais difícil. Na prática clínica, o diferencial baseia-se na temperatura do paciente, na regularidade da febre, e nos outros sintomas clínicos que a acompanham. Existem duas causas clínicas principais de febre, uma infecciosa e a outra não infecciosa. As febres infecciosas são principalmente causadas por infecções microbianas, incluindo bactérias, vírus, micoplasma, clamídia, espiroquetas e parasitas, e podem ser causadas por infecções do sistema respiratório, do sistema digestivo, do sistema urinário e da pele. Outras causas não infecciosas incluem doenças auto-imunes tais como febre reumática, reumatóides, artrite reumatóide, lúpus eritematoso sistémico ou polimiosite; tumores malignos tais como linfoma, tumores ósseos e distúrbios sanguíneos tais como leucemia; e doenças metabólicas tais como hipertiroidismo ou insolação devido a temperaturas ambientais elevadas. Portanto, se tiver febre, especialmente se for recorrente, recomenda-se que procure cuidados médicos imediatos para a identificar através dos testes necessários e para confirmar o diagnóstico e fornecer tratamento imediato.