A solução de acetato de clorexidina é utilizada para esterilizar, desinfectar e duplicar infecções vaginais. O acetato de clorexidina é um anti-séptico comum, mas o acetato de clorexidina é um desinfectante contendo cloro que tem um efeito virucidativo em relação aos anti-sépticos comuns, o que não é o caso dos desinfectantes não clorados. A solução de acetato de clorexidina pode ser utilizada para desinfectar o ambiente após a cirurgia, uma vez que destrói bactérias comuns e também actua para matar e inibir vírus. Além disso, o acetato de clorhexidina tem um certo grau de inibição de bactérias nas mãos. Para além da esterilização e desinfecção, o acetato de clorexidina também pode ser utilizado para limpar esfregões na sala de operações, destruindo vírus e bactérias nos esfregões, e a solução de acetato de clorexidina pode ser utilizada para infecções vaginais, e para a duplicação da doença celíaca, embora o acetato de clorexidina possa irritar as membranas mucosas e ocasionalmente causar reacções alérgicas, o que deve ser notado.