A solução de acetato de clorexidina é utilizada para o tratamento da rinite, limpeza e desinfecção, reduzindo as hipóteses de concepção, desinfecção da pele, limpeza oral e, em certa medida, para condições inflamatórias ou doenças tais como cervicite, vaginite, doença venérea e leucorreia devido a tricomonas, gonorreia, bolor ou outras bactérias patogénicas. Antes da cirurgia ginecológica, procedimentos pré-natais e abortos, é necessário desinfectar e limpar o corpo ou a vagina para reduzir o risco de infecção. A solução de acetato de clorexidina é também utilizada para limpar a boca da paciente antes da relação sexual, para prevenir doenças e reduzir a probabilidade de concepção, ou para estomatite causada por dentaduras. A solução de acetato de clorexidina também pode ser utilizada para desinfecção das mucosas ou da pele. A principal utilização da solução de acetato de clorexidina é para o tratamento de doenças ginecológicas, geralmente em casos de vaginite purulenta e erosão cervical, para limpar e proteger a vagina feminina.