A gravidade da hipoplasia da onda T precisa de ser julgada pelo seu estado e pelo grau de hipoplasia. Em pacientes com doença cardíaca orgânica, a hipoplasia da onda T durante o exercício, stress emocional, etc., com depressão significativa e sintomas acompanhantes, é muito grave e é considerada doença arterial coronária, isquemia miocárdica aguda, ou síndrome coronária aguda e requer tratamento médico. Se necessário, é indicada a intervenção coronária ou a cirurgia de revascularização do miocárdio. No estado fisiológico, a hipoplasia da onda T pode ser causada por exercício extenuante e pode ser aliviada ao evitar os gatilhos relevantes. Se necessário, são administrados medicamentos nutritivos do miocárdio como a trimetazidina e a coenzima Q10 para o tratamento sintomático. Além disso, outras condições, como a cardiomiopatia e a miocardite, podem também apresentar hipoplasia da onda T e requerer um tratamento direccionado, cuja gravidade está relacionada com a causa primária.