Os efeitos adversos da metilcobalamina envolvendo o tracto gastrointestinal são muito leves, ou seja, apenas 5% ou 1 em 1000 pessoas sofrem de perda de apetite, náuseas, vómitos ou diarreia, e estes sintomas não podem ser considerados prejudiciais para o estômago, não causam irritação significativa do tracto gastrointestinal e podem mesmo levar a danos na mucosa gástrica, úlceras gástricas e hemorragias gástricas. A metilcobalamina é uma droga semelhante à vitamina B12, que está principalmente envolvida numa função fisiológica importante no organismo, nomeadamente a circulação de uma unidade de carbono, e por isso pode ser utilizada para tratar neuropatias periféricas, tais como a neurite periférica, dor e dormência dos nervos, etc., causadas por doentes diabéticos. Os efeitos adversos deste medicamento são muito ligeiros e podem incluir irritação gastrointestinal, náuseas, vómitos, diarreia em 1 por 1.000 pessoas e erupções cutâneas isoladas em menos de 1 por 1.000 pessoas. Globalmente, não causa danos significativos ao estômago e pode ser tomado com confiança. No entanto, é importante tomar este medicamento com cuidado. Se os sintomas desta neuropatia, tais como dor e dormência, não melhorarem depois de o tomar durante mais de um mês, não é necessário continuar a tomá-lo.