O terceiro trimestre de gravidez é de cerca de 12 semanas, quando o embrião tomou a sua primeira forma humana, ou seja, a cabeça e os membros desenvolveram-se. Neste caso, não há forma de fazer um aborto em regime ambulatório e terá de ser internado no hospital para um aborto medicamentoso. O primeiro e segundo dias são normalmente passados a tomar mifepristone e o terceiro dia é passado a tomar misoprostol. Se as contracções do útero não forem muito fortes, pode tomar mais 2 comprimidos de misoprostol até a paciente ter contracções e entregar o feto por conta própria, então o médico observará o desenvolvimento do feto e da placenta, e se estiverem intactos, não há necessidade de limpar o útero.