Como a válvula protética é implantada no corpo como um corpo estranho, o contacto do sangue com a superfície cardiovascular interna anormal inicia a resposta de coagulação do corpo, levando à formação de redes de fibrina e coágulos plaquetários, tornando o sangue susceptível à coagulação dentro e à volta da válvula para formar um trombo, o que pode afectar a função da válvula, e o deslocamento do trombo pode resultar em embolia vascular. Por conseguinte, a terapia de anticoagulação é necessária após a substituição da válvula protética para tornar o sangue menos susceptível a coagular. Quer sejam utilizadas válvulas mecânicas ou biológicas, a anticoagulação pós-operatória é necessária. As válvulas mecânicas devem ser anticoaguladas para toda a vida; as válvulas biológicas devem geralmente ser anticoaguladas durante um curto período de tempo (geralmente 3 meses) ou, em casos de fibrilação atrial ou circunstâncias especiais, até 6 meses ou mais após a cirurgia. O tromboembolismo é uma complicação grave da substituição da válvula protética, pelo que uma anticoagulação adequada é essencial para assegurar a eficácia e segurança da substituição da válvula protética.