A gonorreia não se cura por si só sem tratamento, por isso, quando a gonorreia é detectada, normalmente na fase aguda, deve ser tratada de forma agressiva. Por exemplo, a penicilina pode ser preferida, mas também pode ser tratada com medicamentos como o bacteriófago. Se for alérgico às penicilinas, o tratamento pode ser efectuado com eritromicina ou doxiciclina. Para a gonorreia causada por pus tubário ou abcesso tubo-ovariano, se o tratamento medicamentoso for ineficaz, recomenda-se clinicamente o tratamento cirúrgico. Se a gonorreia for associada à gravidez, as mulheres grávidas infectadas com gonorreia podem ter rutura prematura das membranas e infeção na cavidade amniótica, o tratamento baseia-se no tratamento com penicilina e não com tetraciclina e quinolonas.