Não é aconselhável ter relações sexuais porque a infecção por HPV de alto risco sugere que haverá vírus HPV de alto risco no colo do útero e na vagina, e se houver contacto durante o tratamento é capaz de causar novas oportunidades de infecção viral por HPV, o que pode afectar a eficácia do tratamento viral. Uma nova invasão viral pode levar a um novo ciclo de replicação, resultando na multiplicação de um grande número de partículas virais e comprometendo, portanto, a eficácia do tratamento. Na prática clínica, é melhor abster-se de sexo ao tratar infecções virais, ou se inevitável, utilizar medidas de isolamento, tais como preservativos, que podem ajudar a dissuadir o vírus até certo ponto, a fim de tornar o tratamento mais eficaz e minimizar as hipóteses de reinfecção.